সাধারণ অন্ত্রের ব্যাকটেরিয়াল লিপিড A হল 1,4-ডাইফসফেট- β 1,6 যুক্ত গ্লাইকোসামিনোডিস্যাকারাইডগুলি মেরুদণ্ড হিসাবে, এবং সংযুক্ত 3-হাইড্রক্সি ফ্যাটি অ্যাসিড বা 3-অ্যাসিল কার্বক্সিল অবশিষ্টাংশগুলি অ্যামাইড এবং এস্টার বন্ডের সাথে। এই গঠনটি সমস্ত গ্রাম-নেতিবাচক ব্যাকটেরিয়ার জন্য সাধারণ নয়। বিশেষ করে, উপরের গঠনগুলি প্রায়ই এমন পরিবারগুলির সম্মুখীন হয় না যেগুলি কলিফর্ম ব্যাকটেরিয়া থেকে দূরে থাকে, যেমন ব্র্যাডিরাইজোবিয়া।

প্রথমে, প্রাপ্ত লিপিড A-এর গঠনটিকে একটি "অস্বাভাবিক" লিপিড A প্রকার হিসাবে বিবেচনা করা হত, এবং এখন এটির নামকরণ করা হয়েছে লিপিড A বৈকল্পিক হিসাবে। উদাহরণস্বরূপ, Thiobacillus, Rhizobiaceae, Nitrobacter, Brucella, Chromatim Party, Chlorobium N ad son, ইত্যাদি। LPS-এর কঙ্কাল গঠনে এবং এর প্রতিস্থাপনে স্পষ্ট পরিবর্তন রয়েছে। লিপিড A ভেরিয়েন্টের একটি ট্রানজিশনাল টাইপ (বা রূপান্তরিত) ফর্ম রয়েছে, রোডোব্যাক্টর স্প্যারয়েডে, অ্যামাইড-লিঙ্কযুক্ত 3-হাইড্রক্সি ফ্যাটি অ্যাসিডের শুধুমাত্র অংশ 3-অক্সিমিরিস্টিক অ্যাসিড দ্বারা প্রতিস্থাপিত হয়। একটি লিপিড হিসাবে, একটি কঙ্কাল পলিস্যাকারাইড, পিগমেন্টেড ব্যাকটেরিয়ার গ্লাইকোসামিন সবসময় 2,3-ডায়ামিনো-2,3-ডাইডোক্সি-ডি-গ্লুকোজ (DAG) সংযোগের একটি ছোট পরিমাণের সাথে থাকে।

ডিএজি শুধুমাত্র লিপিড এ কঙ্কাল চিনিতে বিদ্যমান। 2,3-ডায়ামিন-2,3-ডাইডোক্সহেক্সোজের ইউরোনিক অ্যাসিড ডেরিভেটিভ সিউডোমোনাস অ্যারুগিনোসার বিভিন্ন সেরোটাইপের ব্যাকটেরিয়া অ্যান্টিজেন (ও চেইন) হিসাবে রিপোর্ট করা হয়েছে।

3- অক্সিমিরিস্টিক অ্যাসিড: 3-অক্সিমাইরিস্টিক অ্যাসিডের উপস্থিতি প্রথম লিস্টেনেলা অ্যাঙ্গুইলারাম এবং এরিথ্রয়েড ব্যাকটেরিয়ায় রিপোর্ট করা হয়েছিল। এখন, প্রকৃতপক্ষে, গ্রাম-নেগেটিভ ব্যাকটেরিয়া α-3 শাখার সমস্ত প্রজাতি এবং স্ট্রেন লক্ষ্য করা যায়।

সবচেয়ে উল্লেখযোগ্য জৈবিক প্রভাব সহ এন্ডোটক্সিন হল ভিন্নধর্মী এলপিএস, যা প্রায়শই কোষের প্রতিক্রিয়া পরীক্ষা করার জন্য এবং থেরাপিউটিক প্রভাবের উপর গবেষণা চালাতে স্ট্যান্ডার্ড হিসাবে ব্যবহৃত হয়। লিপিড A এর জৈবিক ক্রিয়াকলাপের অংশটি β- 1,6 ডি-গ্লুকোসামিন ডিস্যাকারাইড এবং ছয়টি স্যাচুরেটেড ফ্যাটি অ্যাসিড এবং দুটি নেতিবাচক চার্জযুক্ত ফসফেট র্যাডিকেলের সমন্বয়ে গঠিত। এই কাঠামোর বিন্যাসে পরিবর্তন, যেমন চার্জের সংখ্যা হ্রাস, ফ্যাটি অ্যাসিল গ্রুপের হ্রাস, ফ্যাটি অ্যাসিল চেইনের বিতরণের পরিবর্তন এবং ফ্যাটি অ্যাসিল স্যাচুরেশনের মাত্রা তাদের জৈবিক হ্রাসের দিকে নিয়ে যেতে পারে। কার্যক্রম এটি দেখায় যে এন্ডোটক্সিনের প্রাথমিক কাঠামোর পরিবর্তন অনিবার্যভাবে এর শারীরিক রাসায়নিক ক্রিয়াকে প্রভাবিত করবে। সিডেল এট আল। নিশ্চিত করেছেন যে এন্ডোটক্সিনে এলপিএসের স্টেরিওস্ট্রাকচার এর জৈবিক প্রভাবের সাথে ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত। বিভিন্ন ত্রিমাত্রিক কাঠামো বিভিন্ন প্রভাব তৈরি করতে পারে। সাধারণভাবে বলতে গেলে, শঙ্কুযুক্ত স্থানিক কাঠামো প্রায়শই কোষের সক্রিয়করণ প্রভাবের দিকে নিয়ে যায়, যখন LPS-এর নলাকার স্থানিক কাঠামো প্রায়শই কোষের সক্রিয়করণকে বাধা দেওয়ার জন্য এন্ডোটক্সিনের প্রতিপক্ষ।